针对传统科学观中那种基于“旧物理学之上”的科学的原子-还原论，马斯洛还进而揭示了现代科学方法论的整体功能特质。马斯洛的分析是从对心理学的“原始材料”的研究开始的。他让我们注意到，在传统心理学家那里，心理学的原始材料被视为“分解为各种成分或基本单位的那种原本所有的复合状态”③,而在实际上，任何原始的心理学资料都不可能是什么单独的“肌肉痉挛”“基本感觉""反射作用”之类，而必定是人的整体情境的结果。“如果对这一矛盾进行深思，我们很快就会明白，这种对原始材料的寻求本身反映的是一整套世界观，即一种将世界基于原子论假说之上的科学哲学——在这个世界里，复合物都是由单一元素所构成的。”①马斯洛认为，这正是那种“原子论、机械论的世界观在科学上的反映”。从本质上看，这种旧科学观“集原子论、分类说、静态论、因果论和简单机械论于一身”,在方法论上则表现为一种抽象的“还原-分析”(reductive-analytic)法。马斯洛惊呼，这决不是“科学的根本性质”!
在马斯洛看来，现代科学的最新成果越来越突现着一种新的科学系统结构，即整体的功能性特质。与旧科学观不同，这种新科学观“是整体论的而不是原子论的，是功能型的而不是分类型的，是能动的而不是静态的，是动力学的而不是因果式的，是目的论的而不是简单机械论的”②。在方法论上，这种新科学观则表现为“整体-分析”(holis-tic-analytic)。