没有想到，邵友濂到台湾上任后，很快恩将仇报了。邵友濂心里也明白：自己担了刘铭传很大一份人情。不是不报，因为时机过了。他深知朝廷对刘铭传已大不如从前，风光不再，甚至墙倒众人推了。自己接任台湾巡抚，自然要与这个过时的恩人划清界限，不能再言报恩之事了。不报恩亦罢，最好还要与之交恶。如何交恶？导火线便只能是追随刘铭传并得到他力荐的沈应奎了。他要拿沈应奎开刀，以示自己与刘铭传并无丝毫瓜葛。
刘朝灿告诉六爷：邵友濂赴台后大耍手段，对台湾开发建设事宜不管不问，却要来一次“清党”：凡刘铭传提携重用过的人，他一概不用；凡被刘铭传革职处罚过的人，统统给予昭雪复官。而对刘铭传倡办的新政，一概否定，甚至将有些正在建设的项目停建下来。对沈应奎，邵友濂更是横挑鼻子竖挑眼，干脆不安排他的差事，让他坐冷板凳。
